A549 ve BEAS-2B hücre hatlarında borik asitin apoptoz yolağındaki genlerin ekspresyon düzeylerine etkisinin incelenmesi
Citation
Vidinli, Gaye Nur. (2021). A549 ve BEAS-2B hücre hatlarında borik asitin apoptoz yolağındaki genlerin ekspresyon düzeylerine etkisinin incelenmesi. İstinye Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı. Yüksek Lisans Tezi. İstanbul.Abstract
Akciğer kanseri, dünyadaki en yaygın kanser türü olmakla beraber tüm kanser ölümlerinin bir
numaralı nedeni olmaya devam etmektedir. Apoptoz, bir dizi sinyal iletim kaskadları ve
hücresel proteinler tarafından düzenlenen sıkı bir şekilde programlanmış bir hücre ölümü
türüdür. Apoptoz hücre popülasyonlarının homeostazını devam ettirmek için önemli bir
mekanizmadır ve düzensizliği kansere yol açabilir. Apoptoz, kansere karşı en güçlü savunma
mekanizmalarından biridir. Çünkü apoptoz bu süreçte zararlı olabilecek mutasyona uğramış
hücreleri ortadan kaldırmaktadır. Bor elementi tıp alanında (örneğin ilaçların üretimi ve kanser
tedavisi gibi) sterilizasyon uygulamalarında ve endüstriyel alanlarda (cam, seramik, metal,
kozmetik gibi) kullanılmaktadır. Bor bileşikleri, neredeyse tamamen gastrointestinal ve
solunum sistemleri yoluyla vücuda alınmaktadır. Yapılan deneysel çalışmalar borik asitin
antikanserojen etkilerinin olabileceğini göstermektedir. Yapmış olduğumuz çalışmada borik
asitin akciğer kanserindeki moleküler etkileri araştırılmıştır. Borik asitin, apoptoz yolağında
görev alan genlerin ekspresyon seviyelerini nasıl etkilediği ve hücre proliferasyonu ve hücre
canlılığı üzerindeki etkisi araştırılmıştır.
Çalışmamız kapsamında, xCELLigence sistemi kullanılarak, hücre titrasyon analizleri, hücre
proliferasyonundaki farklılıklar ve borik asit muamelesi sonrası hücrenin sitotoksik aktivitesi
belirlendi. İlk olarak hücre titrasyon analizi yapıldı ve borik asit muamelesi için doğru hücre
sayısı belirlendi. Daha sonra belirlemiş olduğumuz hücre sayılarına göre ekim yapıldı ve farklı
konsantrasyonlarda borik asit ile muamele edildi. xCELLigence sistemiyle 24. ve 48. saatteki
borik asitin sitotoksik aktivitesi ve proliferasyon etkisi değerlendirilerek inhibitör
konsantrasyonu (IC50) belirlendi. IC50 değerine göre belirlemiş olduğumuz borik asit
konsantrasyonları ile muamele edilmiş hücrelerden RNA izolasyonu ve sonrasında cDNA
sentezi gerçekleştirildi. Apoptotik yolakta rol alan seçmiş olduğumuz genlerin ekspresyon
seviyeleri Real Time PCR ile belirlendi.
Araştırmanın sonuçlarına göre, A549 akciğer kanseri hücre hattındaki borik asitin farklı
konsantrasyonları, apoptozun intrinsik ve ekstrinsik yolağında etkili olan genler üzerindeki
ekspresyon seviyelerinde değişikliğe neden olduğu gözlendi. Elde ettiğimiz sonuçlardan yola
çıkarak borik asitin akciğer kanserindeki apoptoz mekanizmasıyla ilişkili olabileceği sonucuna
varılmıştır. Lung cancer is the most common type of cancer in the world and remains the number one cause
of all cancer deaths. Apoptosis is a tightly programmed type of cell death regulated by a series
of signal transduction cascades and cellular proteins. Apoptosis is an important mechanism for
maintaining homeostasis of cell populations, and its dysregulation can lead to cancer.
Apoptosis is one of the most powerful defense mechanisms against cancer. Apoptosis
eliminates potentially harmful mutated cells in this process. Boron element is used in medicine
(in the production of various drugs, in vitamin supplements, in areas such as cancer treatment),
in sterilization and cleaning, in various industrial areas (such as glass, ceramics, metal,
cosmetics). Boron compounds are taken into the body almost entirely through the
gastrointestinal and respiratory systems. Experimental studies show that boric acid may have
anticarcinogenic effects. In our study, the molecular effects of boric acid on lung cancer were
investigated. How boric acid affects the expression levels of genes involved in the apoptosis
pathway and its effect on cell proliferation and cell viability were investigated.
In our study, cell titration analysis, differences in cell proliferation and cytotoxic activity of the
cell after boric acid treatment were determined using the xCELLigence system. First, cell
titration analysis was performed and the correct cell number was determined for boric acid
treatment. Then, cell culture was done according to the cell numbers we determined and treated
with different concentrations of boric acid. The inhibitory concentration (IC50) was determined
by evaluating the cytotoxic activity and proliferation effect of boric acid at the 24th and 48th
hours with the xCELLigence system. RNA isolation from cells treated with boric acid
concentrations determined according to IC50 value and then cDNA synthesis was performed.
Expression levels of the selected genes involved in the apoptotic pathway were determined by
Real Time PCR.
According to the results of the study, was observed that different concentrations of boric acid in
the A549 lung cancer cell line caused a change in the expression levels on the genes that are
effective in the intrinsic and extrinsic pathway of apoptosis. Based on our result, it was
concluded that boric acid may be related to the apoptosis mechanism in lung cancer