SU.86.86 metastatik ve bxpc-3 metastatik olmayan pankreas kanser hücre hatlarında keratin 19 (krt19) ve transmembran serin proteaz 4 (tmprss4) genlerinin ifade düzeylerinin karşılaştırılması
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2020
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
İstinye Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/closedAccess
Özet
Çalışmadaki amaç; Bu tez çalışmasında metastatik pankreas kanser hücre hattı SU.86.86 ile metastatik olmayan pankreas kanser hücre hattı BxPC3 hücrelerinde Keratin 19 (KRT 19) ve transmembran serin proteaz 4 (TMPRSS4) genlerinin ifade düzeyleri, transkripsiyonel aşamada belirlenecek ve olası farklılıklar ortaya çıkarılacaktır. Buradan bu iki genin pankreas kanserinde metastatik biyobelirteç olabilme kapasiteleri değerlendirilecektir. Araştırmanın amacı doğrultusunda hücre kültürü teknikleri, RNA izolasyonu, cDNA sentezi ve real time PCR yöntemleri kullanılmıştır. Pankreas hücre hatları kültüre edildikten sonra total RNA izolasyonu yapılıp komplementer DNA’lara dönüştürülmüştür. Kontrol grubu olarak insan bronşiyal epitel hücre hattı BEAS-2B kullanılmıştır. KRT19 ve TMPRSS4 genlerine özgü primerler tasarlanarak real time PCR yapılmıştır. Araştırmada elde edilen gerçek zamanlı PCR sonuçlarının ??Ct hesaplaması sonucunda SU8686 hücre hattında BEAS-2B kontrol hücre hattına göre, TMPRSS4 geninin ifadesinde 1,31 kat azalış olduğu; KRT19 geninin ifadesinde ise 1234 kat artış olduğu saptanmıştır. Değerlendirilen diğer hücre hattı olan BxPC3 hücre hattında yapılan gerçek zamanlı PCR sonuçlarının ??Ct hesaplaması sonucunda BEAS-2B kontrol hücre hattına göre, TMPRSS4 geninin ifadesinde 2,38 kat azalış, KRT19 geninin ifadesinde 183 kat artış saptanmıştır.
The purpose of the study; In this thesis study, expression levels of Keratin 19 (KRT 19) and transmembrane serine protease 4 (TMPRSS4) genes in metastatic pancreatic cancer cell line SU.86.86 and nonmetastatic pancreatic cancer cell line BxPC3 cells will be determined at the transcriptional stage and possible differences will be revealed. Here, the capacity of these two genes to be metastatic biomarkers in pancreatic cancer will be evaluated. Cell culture techniques, RNA isolation, cDNA synthesis and real time PCR methods were used for the purpose of the study. After pancreatic cell lines were cultured, total RNA was isolated and transformed into complementary DNAs. Human bronchial epithelial cell line BEAS-2B was used as a control group. Real time PCR was performed by designing primers specific to KRT19 and TMPRSS4 genes. As a result of the Ct calculation of the real-time PCR results obtained in the study, it was found that the expression of TMPRSS4 gene decreased by 1.31 times in the SU8686 cell line compared to the BEAS-2B control cell line; A 1234-fold increase in expression of the KRT19 gene was found. As a result of the real-time PCR calculation of the BxPC3 cell line, which was the other cell line evaluated, a 2.38-fold decrease in the expression of the TMPRSS4 gene and an 183-fold increase in the expression of the KRT19 gene were found compared to the BEAS-2B control cell line.
The purpose of the study; In this thesis study, expression levels of Keratin 19 (KRT 19) and transmembrane serine protease 4 (TMPRSS4) genes in metastatic pancreatic cancer cell line SU.86.86 and nonmetastatic pancreatic cancer cell line BxPC3 cells will be determined at the transcriptional stage and possible differences will be revealed. Here, the capacity of these two genes to be metastatic biomarkers in pancreatic cancer will be evaluated. Cell culture techniques, RNA isolation, cDNA synthesis and real time PCR methods were used for the purpose of the study. After pancreatic cell lines were cultured, total RNA was isolated and transformed into complementary DNAs. Human bronchial epithelial cell line BEAS-2B was used as a control group. Real time PCR was performed by designing primers specific to KRT19 and TMPRSS4 genes. As a result of the Ct calculation of the real-time PCR results obtained in the study, it was found that the expression of TMPRSS4 gene decreased by 1.31 times in the SU8686 cell line compared to the BEAS-2B control cell line; A 1234-fold increase in expression of the KRT19 gene was found. As a result of the real-time PCR calculation of the BxPC3 cell line, which was the other cell line evaluated, a 2.38-fold decrease in the expression of the TMPRSS4 gene and an 183-fold increase in the expression of the KRT19 gene were found compared to the BEAS-2B control cell line.
Açıklama
Tez Danışmanı: Dr. Öğretim Üyesi Süreyya Bozkurt
Anahtar Kelimeler
Pankreas Kanseri, Keratin 19 Geni, TMPRSS4 Geni, Pancreas Cancer, Keratin 19 Gene, TMPRSS4 Gene
Kaynak
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
Sayı
Künye
Yavuzarslan, S. (2020). Tezin Adı. Metastatik Ve Bxpc-3 Metastatik Olmayan Pankreas
Kanser Hücre Hatlarında Keratin 19 (Krt19) Ve Transmembran Serin Proteaz 4
(Tmprss4) Genlerinin İfade Düzeylerinin Karşılaştırılması. İstinye Üniversitesi Sağlık
Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji Ve Genetik Yüksek Lisans Programı. Yüksek Lisans
Tezi. İstanbul.
