Hct116 kolorektal karsinoma hücre hattında prostaglandin endoperoksit sentaz 2 (PTGS2) ve keratin19 (KRT19) gen anlatımlarının transkripsiyonel düzeyde incelenmesi

dc.contributor.authorCinar, Elif
dc.date.accessioned2020-11-24T08:17:59Z
dc.date.available2020-11-24T08:17:59Z
dc.date.issued2020en_US
dc.date.submitted2020
dc.departmentİstinye Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyolojik Genetik Ana Bilim Dalıen_US
dc.descriptionTez Danışmanı: Dr. Öğretim Üyesi Filiz SAĞLAMen_US
dc.description.abstractÇalışmadaki amaç; HCT116 kolorektal kanser hücre hattında prostaglandin endoperoksit sentaz 2 (PTGS2), Keratin19 (KRT19) genlerinin transkripsiyon düzeyindeki gen anlatımlarının belirlenmesi ve karşılaştırılmasıdır. Bu çalışmada hücre kültürü teknikleri, yarı manuel kit ile RNA izolasyonu, termal döngü cihazında cDNA sentezi ve eş zamanlı kantitatif PCR yöntemleri kullanılmıştır. Kültüre edilen kolon hücre hattından total RNA izole edilip enzimatik olarak tamamlayıcı DNA’lara dönüştürülmüştür. Son olarak PTGS ve KRT19 genlerine özgü tasarlanan primerler ile eş zamanlı PCR yapılmıştır. Sonuç olarak gerçek zamanlı PCR sonuçlarının delta delta Ct hesaplaması ile HCT116 hücre hattında KRT19 gen ifadesinde 93,7 kat artış olduğu; PTGS2 gen ifadesinde ise 5,88 kat azalma olduğu saptanmıştır. PTGS2 ve KRT19 genlerinin kolorektal kanser gelişiminde rol alabileceği ve ileride yapılacak detaylı çalışmalarla prognostik öneme sahip olacağı ön görülmektedir.en_US
dc.description.abstractThe purpose of the study; HCT116 is the determination and comparison of gene expression at the level of transcription of Prostaglandin Endoperoxide Synthase 2 (PTGS2), Keratin19 (KRT19) genes in colorectal cell line. In this study, cell culture techniques, RNA isolation with semi-manual kit, cDNA synthesis in the thermal loop device and simultaneous quantitative PCR methods were used. Total RNA was isolated from the cultured colon cell line and transformed into complementary DNA enzymatically. Finally, PCR was performed simultaneously with the primers designed for PTGS2 and KRT19 genes. As a result, there was 93,7 fold increase in KRT19 gene expression in the HCT116 cell line with the delta delta Ct calculation of the real-time PCR results; PTGS2 gene expression was found to be 5,88 time less. It is predicted that PTGS2 and KRT19 genes may play a role in the development of colorectal cancer and will have prognostic significance with future studies.en_US
dc.identifier.citationCinar, E. (2020). Hct116 kolorektal karsinoma hücre hattında prostaglandin endoperoksit sentaz 2 (PTGS2) ve keratin19 (KRT19) gen anlatımlarının transkripsiyonel düzeyde incelenmesi. İstinye Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. İstanbul.en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12713/1246
dc.language.isotren_US
dc.publisherİstinye Üniversitesi / Sağlık Bilimleri Enstitüsüen_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectKolorektal Karsinomaen_US
dc.subjectQPCRen_US
dc.subjectPTGS2en_US
dc.subjectKRT19en_US
dc.subjectColorectal Carcinomaen_US
dc.titleHct116 kolorektal karsinoma hücre hattında prostaglandin endoperoksit sentaz 2 (PTGS2) ve keratin19 (KRT19) gen anlatımlarının transkripsiyonel düzeyde incelenmesien_US
dc.title.alternativeTranscriptional examination of gene prostaglandin endoperoxide synthase 2 (PTGS2) and keratin19 (KRT19) expression in HCT116 colorectal carcinoma cell lineen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
10324267.pdf
Boyut:
830.04 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama: