Distinctive SIRE1 retrotransposon patterns on barley chromosomes?

Basit Öğe Kaydı
dc.authoridElif Karlık / 0000-0003-0669-2725en_US
dc.authoridNermin Gözükırmızı / 0000-0002-7129-3045en_US
dc.authorscopusidNermin Gözükırmızı / 6701520637
dc.authorscopusidElif Karlık / 56926577900
dc.authorwosidNermin Gözükırmızı / M-1419-2013
dc.authorwosidElif Karlık / N-6348-2018
dc.contributor.authorGözükırmızı, Nermin
dc.contributor.authorKarlık, Elif
dc.date.accessioned2022-06-09T07:54:39Z
dc.date.available2022-06-09T07:54:39Z
dc.date.issued2021en_US
dc.departmentİstinye Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümüen_US
dc.description.abstractSIRE1 is an active and relatively high copy-number retroelement belongs to the Tyl/Copia long terminal repeat (LTR) retrotransposon superfamily. Distinctive SIRE1 elements (ENV and GAG) distributions in barley genome were observed by using fluorescent in situ hybridization (FISH). We performed PCR to obtain tetramethylrhodamine-dUTP (TRITC)-labelled probes. Localizations of SIRE1 ENV and GAG domains were demonstrated under confocal microscope on Hordeum vulgare L. cv. Hasat root preparations. Our results revealed the distributions of SIRE1 elements ENV and GAG in barley genome. These results may provide to uncover the organization of SIRE retrotransposon pattern in barley genome.en_US
dc.description.abstractSIRE1, Tyl/Copia Uzun Uç Tekrarlı (Long Terminal Repeats- LTR) retrotranspozon üst ailesine ait olan aktif, nispeten yüksek kopyalı bir retroementtir. Arpa genomundaki ayırt edici SIRE1 elementlerinin (ENV ve GAG) dağılımları floresan in situ hibridizasyonu (FISH) kullanılarak gözlemlendi. Tetramethylrhodamine-dUTP (TRITC)-işaretli probların elde edilmesinde PCR gerçekleştirildi. SIRE1 ENV ve GAG domainlerinin yerleşimleri, Hordeum vulgare L. cv. Hasat kök preparatlarında konfokal mikroskobu altında gösterildi. Sonuçlarımız, arpa genomundaki SIRE1 elementlerinin ENV ve GAG dağılımlarını göstermektedir. Bu sonuçlar, SIRE1 elementlerinin arpa genomunun organizasyonunun ortaya çıkarılmasına katkı sağlayacaktır.en_US
dc.identifier.citationKarlık, E. & Gozukirmizi, N. (2021). DISTINCTIVE SIRE1 RETROTRANSPOSON PATTERNS ON BARLEY CHROMOSOMES? . Trakya University Journal of Natural Sciences , 22 (1) , 9-15 . DOI: 10.23902/trkjnat.773302en_US
dc.identifier.doi10.23902/trkjnat.773302en_US
dc.identifier.endpage15en_US
dc.identifier.issn2528-9691en_US
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage9en_US
dc.identifier.trdizinid492949en_US
dc.identifier.urihttp://doi.org/10.23902/trkjnat.773302
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12713/2844
dc.identifier.volume22en_US
dc.identifier.wosWOS:000640796400002en_US
dc.identifier.wosqualityN/Aen_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.institutionauthorGözükırmızı, Nermin
dc.institutionauthorKarlık, Elif
dc.language.isoenen_US
dc.publisherDergiParken_US
dc.relation.ispartofTrakya University Journal of Natural Sciencesen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectFluorescence in Situ Hybridizationen_US
dc.subjectRetrotransposonen_US
dc.subjectSIRE1en_US
dc.subjectBarleyen_US
dc.subjectENVen_US
dc.subjectGAGen_US
dc.titleDistinctive SIRE1 retrotransposon patterns on barley chromosomes?en_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
10.23902-trkjnat.773302-1214325.pdf
Boyut:
854.45 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Makale Koleksiyonu
TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu